药学院党委成立于2004年，现有师生党员463人，设有师生党支部共23个，在2年建设周期内保持稳定。

药学院党委不断加强党的政治建设，发挥领导核心作用，通过规范执行学院党政联席会议和党组织会议制度、学院党员领导干部联系党支部制度、党支部工作例会制度，优化院（系）运行机制；制定实施了《广东药科大学药学院课程思政建设工作方案》《广东药科大学药学院师德教育实施方案》《广东药科大学药学院党史学习教育工作实施方案》等系列工作方案，落实党建工作重点任务，提升师生思想政治工作质量，为促进药学人才培养、科学研究、社会服务等工作提供坚强的政治、思想和组织保证。

近5年来,药学院党委于2021年获中共广东省委教育工委、中共广东省教育厅党组授予“先进基层党组织”称号；药学院党委、药学院安全用药宣传服务队党支部分别通过广东高校第三批新时代高校党建示范创建和质量创优工作“标杆院系”和“样板支部”培育创建单位立项和验收；药学院药物制剂党支部获得广东高校第五批新时代高校党建示范创建和质量创优工作“样板支部”培育创建单位立项。此外，学院党委分别于2020年、2021年、2023年获评广东药科大学“先进基层党组织”称号。学院教工党员高晓霞教授于2021年获中共广东省委教育工委、中共广东省教育厅党组授予“优秀共产党员”称号，获评2021年“南粤优秀教师”称号。学院1个案例获广东高校“基层党支部组织生活创新案例”一等奖；学院党员承担了6项省级党建工作研究课题，4项省级思政类课题。